Комментарий авторов к публикации «Вклад различных механизмов генерации альтернативных транскриптов в разнообразие мРНК гибридного онкогена RUNX1-RUNX1T1 человека»

  • Илья Николаевич Ильюшёнок Белорусский государственный университет, пр. Независимости, 4, 220030, г. Минск, Беларусь https://orcid.org/0000-0002-5377-366X
  • Лев Иванович Полховский Белорусский государственный университет, пр. Независимости, 4, 220030, г. Минск, Беларусь
  • Василий Викторович Гринев Белорусский государственный университет, пр. Независимости, 4, 220030, г. Минск, Беларусь
DOI: https://doi.org/10.33581/2521-1722-2020-2-90-94

Аннотация

Критически рассматриваются недостатки, обнаруженные в оригинальной статье «Вклад различных механизмов генерации альтернативных транскриптов в разнообразие мРНК гибридного онкогена RUNX1-RUNX1T1 человека», которая была опубликована в издании «Журнал Белорусского государственного университета. Биология» (2019, № 2). Также авторы представляют новые данные по теме исследования, полученные с момента публикации.

Биографии авторов

Илья Николаевич Ильюшёнок, Белорусский государственный университет, пр. Независимости, 4, 220030, г. Минск, Беларусь

ассистент кафедры генетики биологического факультета

Лев Иванович Полховский, Белорусский государственный университет, пр. Независимости, 4, 220030, г. Минск, Беларусь

студент биологического факультета. Научный руководитель – И. Н. Ильюшёнок

Василий Викторович Гринев, Белорусский государственный университет, пр. Независимости, 4, 220030, г. Минск, Беларусь

кандидат биологических наук, доцент; доцент кафедры генетики биологического факультета

Литература

  1. Ilyushonak IM, Migas AA, Sukhareuski AY, Schneider AD, Grinev VV. The contribution of various mechanisms to mRNA diversity of human fusion oncogene RUNX1-RUNX1T1. Journal of the Belarusian State University. Biology. 2019;2:45–59. Russian. DOI: 10.33581/2521-1722-2019-2-45-59.
  2. Ishqi HM, Husain MA, Rehman SU, Sarwar T, Tabish M. Identification and expression of alternatively spliced novel isoforms of cancer associated MYD88 lacking death domain in mouse. Molecular Biology Reports. 2018;45(5):699–711. DOI: 10.1007/s11033-018-4209-5.
  3. Houseley J, Tollervey D. Apparent non-canonical trans-splicing is generated by reverse transcriptase in vitro. PLOS ONE [Internet]. 2010 [cited 2020 April 20];5(8):e12271. Available from: https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0012271. DOI: 10.1371/journal.pone.0012271.
  4. Mader RM, Schmidt WM, Sedivy R, Rizovski B, Braun J, Kalipciyan M, et al. Reverse transcriptase template switching during reverse transcriptase – polymerase chain reaction: artificial generation of deletions in ribonucleotide reductase mRNA. Translational Research. The Journal of Laboratory and Clinical Medicine. 2001;137(6):422–428. DOI: 10.1067/mlc.2001.115452.
  5. Delviks KA, Pathak VK. Effect of distance between homologous sequences and 3′ homology on the frequency of retroviral reverse transcriptase template switching. Journal of Virology. 1999;73(10):7923–7932. DOI: 10.1128/JVI.73.10.7923-7932.1999.
  6. Cariello NF, Thilly WG, Swenberg JA, Skopek TR. Deletion mutagenesis during polymerase chain reaction: dependence on DNA polymerase. Gene. 1991;99(1):105–108. DOI: 10.1016/0378-1119(91)90040-I.
  7. Markham NR, Zuker M. DINAMelt web server for nucleic acid melting prediction. Nucleic Acids Research. 2005;33(suppl_2):W577–W581. DOI: 10.1093/nar/gki591.
  8. Birol I, Raymond A, Chiu R, Nip KM, Jackman SD, Kreitzman M, et al. KLEAT: cleavage site analysis of transcriptomes. In: Altman RB, Dunker AK, Hunter L, Ritchie MD, Murray T, Klein TE, editors. Pacific symposium on biocomputing 2015; 4–8 January 2015; Kohala Coast, Hawaii, USA. New Jersey: World Scientific; 2015. p. 347–358.
  9. Arefeen A, Liu J, Xiao X, Jiang T. TAPAS: tool for alternative polyadenylation site analysis. Bioinformatics. 2018;34(15):2521–2529. DOI: 10.1093/bioinformatics/bty110.
Опубликован
2020-09-12
Ключевые слова: гибридный онкоген RUNX1-RUNX1T1, альтернативный сплайсинг РНК, высокопроизводительное секвенирование, биологический шум
Поддерживающие организации Работа выполнена в рамках подпрограммы «Объединение» государственной программы научных исследований «Конвергенция-2020» (задание 3.08.03 (№ 469/54)).
Как цитировать
Ильюшёнок, И. Н., Полховский, Л. И., & Гринев, В. В. (2020). Комментарий авторов к публикации «Вклад различных механизмов генерации альтернативных транскриптов в разнообразие мРНК гибридного онкогена RUNX1-RUNX1T1 человека». Экспериментальная биология и биотехнология, 2, 90-94. https://doi.org/10.33581/2521-1722-2020-2-90-94
Выпуск
№ 2 (2020): Журнал Белорусского государственного университета. Биология
Раздел
Краткие сообщения

Copyright (c) 2020 Журнал Белорусского государственного университета. Биология

Лицензия Creative Commons

Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial» («Атрибуция — Некоммерческое использование») 4.0 Всемирная.

Авторы, публикующиеся в данном журнале, соглашаются со следующим:

  1. Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial. 4.0 International (CC BY-NC 4.0).
  2. Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договоренности, касающиеся неэксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге) со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.
  3. Авторы имеют право размещать их работу в интернете (например, в институтском хранилище или на персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу. (См. The Effect of Open Access).