Разработка микросателлитной панели для идентификации биологических образцов лося (Alces alces) в судебно-экспертных исследованиях
Аннотация
Для судебно-экспертного исследования биологических следов с мест незаконной охоты на лося разработана панель из 15 микросателлитных (4 тетрануклеотидных и 11 динуклеотидных) локусов и 1 гендерного локуса (амелогенин), реализованная в виде 2 мультиплексных тест-систем. Совокупная сила дискриминирующего потенциала микросателлитной панели на основе общей базы генотипов лося составляет более 99,999 999 999 999 %. Впервые на территории Европы генетические и криминалистические показатели панели локусов оценены на популяционной выборке лосей в масштабе страны (383 образца), а судебно-экспертная методика ДНК-идентификации биологических образцов лося (Alces alces) внедрена в национальную правовую систему.
Литература
- Chistiakov DA, Hellemans B, Volckaert FAM. Microsatellites and their genomic distribution, evolution, function and applications: a review with special reference to fish genetics. Aquaculture. 2006;255(1–4):1–29. DOI: 10.1016/j.aquaculture.2005.11.031.
- Engel SR, Linn RA, Taylor JF. Conservation of microsatellite loci across species of artiodactyls: implications for population studies. Journal of Mammalogy. 1996;77(2):504–518. DOI: 10.2307/1382825.
- Miller WL, Edson J, Pietrandrea P, Miller-Butterworth C, Walter WD. Identification and evaluation of a core microsatellite panel for use in white-tailed deer (Odocoileus virginianus). BMC Genetics. 2019;20:49. DOI: 10.1186/s12863-019-0750-z.
- Linacre AMT, Tobe SS. Wildlife DNA analysis. Applications in forensic science. Hoboken: Wiley-Blackwell; 2013. 352 p. DOI: 10.1002/9781118496411.
- Bishop MD, Kappes SM, Keele JW, Stone RT, Sunden SL, Hawkins GA, et al. A genetic linkage map for cattle. Genetics. 1994;136(2):619–639. DOI: 10.1093/genetics/136.2.619.
- Wilson GA, Strobeck C, Wu L, Coffin JW. Characterization of microsatellite loci in caribou Rangifer tarandus, and their use in other artiodactyls. Molecular Ecology. 1997;6:697–699. DOI: 10.1046/j.1365-294x.1997.00237.x.
- Meredith EP, Rodzen JA, Levine KF, Banks JD. Characterization of an additional 14 microsatellite loci in California Elk (Cervus elaphus) for use in forensic and population applications. Conservation Genetics. 2005;6(1):151–153. DOI: 10.1007/s10592-004-7735-8.
- Cronin MA, Patton JC, Balmysheva N, MacNeil MD. Genetic variation in caribou and reindeer (Rangifer tarandus). Animal Genetics. 2003;34(1):33–41. DOI: 10.1046/j.1365-2052.2003.00927.x.
- Gurgul A, Radko A, Słota E. Characteristics of X- and Y-chromosome specific regions of the amelogenin gene and a PCR-based method for sex identification in red deer (Cervus elaphus). Molecular Biology Reports. 2010;37:2915–2918. DOI: 10.1007/s11033-009-9852-4.
- Peakall R, Smouse PE. GenAlEx 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes. 2006;6(1):288–295. DOI: 10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x.
- Goudet J. FSTAT (version 1.2): a computer program to calculate F-statistics. Journal of Heredity. 1995;86(6):485–486. DOI: 10.1093/oxfordjournals.jhered.a111627.
- Raymond M, Rousset F. Genepop (version 1.2): population genetics software for exact tests and ecumenicism. Journal of Heredity. 1995;86(3):248–249. DOI: 10.1093/oxfordjournals. jhered.a111573.
- Excoffier L, Lischer HEL. Arlequin suite ver. 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Molecular Ecology Resources. 2010;10(3):564–567. DOI: 10.1111/j.1755-0998.2010.02847.x.
- Van Oosterhout C, Hutchinson WF, Wills DPM, Shipley P. Micro‐Checker: software for identifying and correcting genotyping errors in microsatellite data. Molecular Ecology Notes. 2004;4(3):535–538. DOI: 10.1111/j.1471-8286.2004.00684.x.
- Valière N. Gimlet: a computer program for analysing genetic individual identification data. Molecular Ecology Notes. 2002;2(3):377–379. DOI: 10.1046/j.1471-8286.2002.00228.x-i2.
- Marshall TC, Slate J, Kruuk LEB, Pemberton JM. Statistical confidence for likelihood‐based paternity inference in natural populations. Molecular Ecology. 1998;7(5):639–655. DOI: 10.1046/j.1365-294x.1998.00374.x.
- Jones KC, Levine KF, Banks JD. Characterization of 11 polymorphic tetranucleotide microsatellites for forensic applications in California elk (Cervus elaphus canadensis). Molecular Ecology Notes. 2002;2(4):425–427. DOI: 10.1046/j.1471-8278.2002.00264.x.
- Socratous E, Graham E, Rutty GN. Forensic DNA profiling of Cervus elaphus species in the United Kingdom. Forensic Science International: Genetics Supplement Series. 2009;2(1):281–282. DOI: 10.1016/j.fsigss.2009.08.127.
- Botstein D, White RL, Skolnick M, Davis RW. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetics. 1980;32(3):314–331.
- Tsybovsky IS, Kotova SA, Zabavskaya TV, Spivak EA, Lukashkova ON. DNA identification of biological traces in forensic casework for investigation of illegal hunting in Belarus. Theory and Practice of Forensic Science. 2018;13(4):116–123. DOI: 10.30764/10.30764/1819-2785-2018-13-4-116-12317.
- Burbaitė L, Csányi S. Red deer population and harvest changes in Europe. Acta Zoologica Lituanica. 2010;20(4):179–188. DOI: 10.2478/v10043-010-0038-z.
- Ball MC, Finnegan LA, Nette T, Broders HG, Wilson PJ. Wildlife forensics: «supervised» assignment testing can complicate the association of suspect cases to source populations. Forensic Science International: Genetics. 2011;5(1):50–56. DOI: 10.1016/j.fsigen.2010.02.002.
- Sim Z, Monderman L, Hildebrand D, Packer T, Jobin RM. Development and implementation of a STR based forensic typing system for moose (Alces alces). Forensic Science International: Genetics. 2021;53:102536. DOI: 10.1016/j.fsigen.2021.102536.
- Kotava SA, Tsybovsky IS, Rybakova VI, Nedzvedskaya DE, Zabauskaya TV, Spivak EA, et al. Metodika DNK-identifikatsii biologicheskikh obraztsov zhivotnykh vida los’ evropeiskii (Alces alces) [Method of DNA identification of biological samples of animals of the European elk species (Alces alces)]. Tsybovskii IS, editor. Minsk: Informatsionno-vychislitel’nyi tsentr Ministerstva finansov Respubliki Belarus’; 2019. 34 p. Russian.
Copyright (c) 2022 Экспериментальная биология и биотехнология
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial» («Атрибуция — Некоммерческое использование») 4.0 Всемирная.
Авторы, публикующиеся в данном журнале, соглашаются со следующим:
- Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial. 4.0 International (CC BY-NC 4.0).
- Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договоренности, касающиеся неэксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге) со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.
- Авторы имеют право размещать их работу в интернете (например, в институтском хранилище или на персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу. (См. The Effect of Open Access).