Анализ точек разрыва при делециях гена IKZF1 у пациентов с острым лимфобластным лейкозом из В-клеток-предшественников
Аннотация
Помимо давно известных диагностически значимых перестроек при остром лимфобластном лейкозе из В-клеток-предшественников, таких как BCR::ABL1, TCF3::PBX1 (E2A::PBX1) и KMT2A (MLL), значительный интерес для прогнозирования течения заболевания представляют мутации в генах транскрипционных факторов, контролирующих лимфоидную дифференцировку, в первую очередь мутации в гене IKZF1. Ген IKZF1 кодирует ДНК-связывающий белок Ikaros – ключевой транскрипционный фактор, регулирующий ранние этапы дифференцировки Т- и В-лимфоцитов, NK-клеток и дендритных клеток. При остром лимфобластном лейкозе из B-клеток-предшественников наиболее распространенными генетическими событиями, затрагивающими ген IKZF1, являются внутригенные делеции, приводящие к потере нескольких экзонов. Эти делеции наблюдаются у пациентов детского и взрослого возраста, их частота увеличивается при наличии транслокации BCR::ABL1. Также известны нарушения сплайсинга, выраженные в повышенной экспрессии коротких транскриптов (изоформ) гена IKZF1. Однако в подавляющем большинстве случаев повышенная экспрессия коротких изоформ является следствием внутригенной делеции. Данные молекулярно-генетические изменения обусловливают нарушение регуляции дифференцировки лимфоидных клеток и ассоциируются с плохим прогнозом для пациентов с острым лимфобластным лейкозом из В-клеток-предшественников. Понимание генетических изменений в ключевых транскрипционных факторах, таких как Ikaros, может дать ценные сведения о биологии острого лимфобластного лейкоза из В-клеток-предшественников и помочь в прогнозировании клинических результатов для пациентов с этим заболеванием.
Литература
- Inaba H, Mullighan CG. Pediatric acute lymphoblastic leukemia. Haematologica. 2020;105(11):2524–2539. DOI: 10.3324/hae¬ matol.2020.247031.
- Bhojwani D, Yang JJ, Pui C-H. Biology of childhood acute lymphoblastic leukemia. Pediatric Clinics of North America. 2015; 62(1):47–60. DOI: 10.1016/j.pcl.2014.09.004.
- Mullighan CG. Genomic characterization of childhood acute lymphoblastic leukemia. Seminars in Hematology. 2013;50(4):314–324. DOI: 10.1053/j.seminhematol.2013.10.001.
- Vairy S, Tran TH. IKZF1 alterations in acute lymphoblastic leukemia: the good, the bad and the ugly. Blood Reviews. 2020;44:100677. DOI: 10.1016/j.blre.2020.100677.
- Stanulla M, Cavé H, Moorman AV. IKZF1 deletions in pediatric acute lymphoblastic leukemia: still a poor prognostic marker? Blood. 2020;135(4):252–260. DOI: 10.1182/blood.2019000813.
- Iacobucci I, Kimura S, Mullighan CG. Biologic and therapeutic implications of genomic alterations in acute lymphoblastic leukemia. Journal of Clinical Medicine. 2021;10(17):3792. DOI: 10.3390/jcm10173792.
- Klco JM, Mullighan CG. Advances in germline predisposition to acute leukaemias and myeloid neoplasms. Nature Reviews Cancer. 2021;21(2):122–137. DOI: 10.1038/s41568-020-00315-z.
- Vshyukova VS, Krasko OV, Yanchanka DA, Meleshko AN. Aberrant IKZF1 gene as relapse predictor in standard‐risk pediatric patients with B‐cell precursor acute lymphoblastic leukaemia. International Journal of Laboratory Hematology. 2022;44(4):769–776. DOI: 10.1111/ijlh.13853.
- Olsson L, Johansson B. Ikaros and leukaemia. British Journal of Haematology. 2015;169(4):479–491. DOI: 10.1111/bjh.13342.
- Vshivkova VS, Meleshko AN. The role of Ikaros transcriptional factor in normal hematopoiesis and leukemogenesis: biological and clinical aspects. Advances in Molecular Oncology. 2015;2(1):13–26. Russian. DOI: 10.17650/2313-805X.2015.2.1.013-026.
- Yadav V, Ganesan P, Veeramani R, Dinesh Kumar V. Philadelphia-like acute lymphoblastic leukemia: a systematic review. Clinical Lymphoma Myeloma and Leukemia. 2021;21(1):e57 – e65. DOI: 10.1016/j.clml.2020.08.011.
- Xia R, Cheng Y, Han X, Wei Y, Wei X. Ikaros proteins in tumor: current perspectives and new developments. Frontiers in Molecular Biosciences. 2021;8:788440. DOI: 10.3389/fmolb.2021.788440.
- Affar M, Bottardi S, Quansah N, Lemarié M, Ramón AC, Affar EB, et al. Ikaros: from chromatin organization to transcriptional elongation control. Cell Death & Differentiation [Internet]. 2023 August 24 [cited 2024 March 17]. Available from: https://www.nature.com/articles/s41418-023-01212-2. Epub ahead of print. DOI: 10.1038/s41418-023-01212-2.
- Wang Y, Cheng W, Zhang Yv, Zhang Yu, Sun T, Zhu Y, et al. Identification of IKZF1 genetic mutations as new molecular subtypes in acute myeloid leukaemia. Clinical and Translational Medicine. 2023;13(6):e1309. DOI: 10.1002/ctm2.1309.
- Merelli I, Guffanti A, Fabbri M, Cocito A, Furia L, Grazini U, et al. RSSsite: a reference database and prediction tool for the identification of cryptic recombination signal sequences in human and murine genomes. Nucleic Acids Research. 2010;38(supplement 2):W262 – W267. DOI: 10.1093/nar/gkq391.
Copyright (c) 2024 Экспериментальная биология и биотехнология
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial» («Атрибуция — Некоммерческое использование») 4.0 Всемирная.
Авторы, публикующиеся в данном журнале, соглашаются со следующим:
- Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial. 4.0 International (CC BY-NC 4.0).
- Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договоренности, касающиеся неэксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге) со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.
- Авторы имеют право размещать их работу в интернете (например, в институтском хранилище или на персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу. (См. The Effect of Open Access).