Анализ точек разрыва при делециях гена IKZF1 у пациентов с острым лимфобластным лейкозом из В-клеток-предшественников

  • Мария Александровна Керезь Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии, ул. Фрунзенская, 43, 223053, д. Боровляны, Боровлянский с/с, Минский р-н, Беларусь
  • Дарья Александровна Богатенкова Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии, ул. Фрунзенская, 43, 223053, д. Боровляны, Боровлянский с/с, Минский р-н, Беларусь
  • Ольга Сергеевна Вшивкова Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии, ул. Фрунзенская, 43, 223053, д. Боровляны, Боровлянский с/с, Минский р-н, Беларусь
  • Александр Николаевич Мелешко Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии, ул. Фрунзенская, 43, 223053, д. Боровляны, Боровлянский с/с, Минский р-н, Беларусь

Аннотация

Помимо давно известных диагностически значимых перестроек при остром лимфобластном лейкозе из В-клеток-предшественников, таких как BCR::ABL1, TCF3::PBX1 (E2A::PBX1) и KMT2A (MLL), значительный интерес для прогнозирования течения заболевания представляют мутации в генах транскрипционных факторов, контролирующих лимфоидную дифференцировку, в первую очередь мутации в гене IKZF1. Ген IKZF1 кодирует ДНК-связывающий белок Ikaros – ключевой транскрипционный фактор, регулирующий ранние этапы дифференцировки Т- и В-лимфоцитов, NK-клеток и дендритных клеток. При остром лимфобластном лейкозе из B-клеток-предшественников наиболее распространенными генетическими событиями, затрагивающими ген IKZF1, являются внутригенные делеции, приводящие к потере нескольких экзонов. Эти делеции наблюдаются у пациентов детского и взрослого возраста, их частота увеличивается при наличии транслокации BCR::ABL1. Также известны нарушения сплайсинга, выраженные в повышенной экспрессии коротких транскриптов (изоформ) гена IKZF1. Однако в подавляющем большинстве случаев повышенная экспрессия коротких изоформ является следствием внутригенной делеции. Данные молекулярно-генетические изменения обусловливают нарушение регуляции дифференцировки лимфоидных клеток и ассоциируются с плохим прогнозом для пациентов с острым лимфобластным лейкозом из В-клеток-предшественников. Понимание генетических изменений в ключевых транскрипционных факторах, таких как Ikaros, может дать ценные сведения о биологии острого лимфобластного лейкоза из В-клеток-предшественников и помочь в прогнозировании клинических результатов для пациентов с этим заболеванием.

Биографии авторов

Мария Александровна Керезь, Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии, ул. Фрунзенская, 43, 223053, д. Боровляны, Боровлянский с/с, Минский р-н, Беларусь

младший научный сотрудник лаборатории генетических биотехнологий

Дарья Александровна Богатенкова, Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии, ул. Фрунзенская, 43, 223053, д. Боровляны, Боровлянский с/с, Минский р-н, Беларусь

младший научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических исследований

Ольга Сергеевна Вшивкова, Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии, ул. Фрунзенская, 43, 223053, д. Боровляны, Боровлянский с/с, Минский р-н, Беларусь

кандидат биологических наук; ведущий научный сотрудник лаборатории генетических биотехнологий, ученый секретарь

Александр Николаевич Мелешко, Республиканский научно-практический центр детской онкологии, гематологии и иммунологии, ул. Фрунзенская, 43, 223053, д. Боровляны, Боровлянский с/с, Минский р-н, Беларусь

кандидат биологических наук; ведущий научный сотрудник лаборатории генетических биотехнологий

Литература

  1. Inaba H, Mullighan CG. Pediatric acute lymphoblastic leukemia. Haematologica. 2020;105(11):2524–2539. DOI: 10.3324/hae¬ matol.2020.247031.
  2. Bhojwani D, Yang JJ, Pui C-H. Biology of childhood acute lymphoblastic leukemia. Pediatric Clinics of North America. 2015; 62(1):47–60. DOI: 10.1016/j.pcl.2014.09.004.
  3. Mullighan CG. Genomic characterization of childhood acute lymphoblastic leukemia. Seminars in Hematology. 2013;50(4):314–324. DOI: 10.1053/j.seminhematol.2013.10.001.
  4. Vairy S, Tran TH. IKZF1 alterations in acute lymphoblastic leukemia: the good, the bad and the ugly. Blood Reviews. 2020;44:100677. DOI: 10.1016/j.blre.2020.100677.
  5. Stanulla M, Cavé H, Moorman AV. IKZF1 deletions in pediatric acute lymphoblastic leukemia: still a poor prognostic marker? Blood. 2020;135(4):252–260. DOI: 10.1182/blood.2019000813.
  6. Iacobucci I, Kimura S, Mullighan CG. Biologic and therapeutic implications of genomic alterations in acute lymphoblastic leukemia. Journal of Clinical Medicine. 2021;10(17):3792. DOI: 10.3390/jcm10173792.
  7. Klco JM, Mullighan CG. Advances in germline predisposition to acute leukaemias and myeloid neoplasms. Nature Reviews Cancer. 2021;21(2):122–137. DOI: 10.1038/s41568-020-00315-z.
  8. Vshyukova VS, Krasko OV, Yanchanka DA, Meleshko AN. Aberrant IKZF1 gene as relapse predictor in standard‐risk pediatric patients with B‐cell precursor acute lymphoblastic leukaemia. International Journal of Laboratory Hematology. 2022;44(4):769–776. DOI: 10.1111/ijlh.13853.
  9. Olsson L, Johansson B. Ikaros and leukaemia. British Journal of Haematology. 2015;169(4):479–491. DOI: 10.1111/bjh.13342.
  10. Vshivkova VS, Meleshko AN. The role of Ikaros transcriptional factor in normal hematopoiesis and leukemogenesis: biological and clinical aspects. Advances in Molecular Oncology. 2015;2(1):13–26. Russian. DOI: 10.17650/2313-805X.2015.2.1.013-026.
  11. Yadav V, Ganesan P, Veeramani R, Dinesh Kumar V. Philadelphia-like acute lymphoblastic leukemia: a systematic review. Clinical Lymphoma Myeloma and Leukemia. 2021;21(1):e57 – e65. DOI: 10.1016/j.clml.2020.08.011.
  12. Xia R, Cheng Y, Han X, Wei Y, Wei X. Ikaros proteins in tumor: current perspectives and new developments. Frontiers in Molecular Biosciences. 2021;8:788440. DOI: 10.3389/fmolb.2021.788440.
  13. Affar M, Bottardi S, Quansah N, Lemarié M, Ramón AC, Affar EB, et al. Ikaros: from chromatin organization to transcriptional elongation control. Cell Death & Differentiation [Internet]. 2023 August 24 [cited 2024 March 17]. Available from: https://www.nature.com/articles/s41418-023-01212-2. Epub ahead of print. DOI: 10.1038/s41418-023-01212-2.
  14. Wang Y, Cheng W, Zhang Yv, Zhang Yu, Sun T, Zhu Y, et al. Identification of IKZF1 genetic mutations as new molecular subtypes in acute myeloid leukaemia. Clinical and Translational Medicine. 2023;13(6):e1309. DOI: 10.1002/ctm2.1309.
  15. Merelli I, Guffanti A, Fabbri M, Cocito A, Furia L, Grazini U, et al. RSSsite: a reference database and prediction tool for the identification of cryptic recombination signal sequences in human and murine genomes. Nucleic Acids Research. 2010;38(supplement 2):W262 – W267. DOI: 10.1093/nar/gkq391.
Опубликован
2024-11-18
Ключевые слова: IKZF1, Ikaros, криптические сигнальные последовательности рекомбинации, cRSS, острый лимфобластный лейкоз из В-клеток-предшественников, В-ОЛЛ, точки разрыва, сайты рекомбинации, горячие точки, делеции
Поддерживающие организации Работа выполнена в рамках государственной научно-технической программы «Научно-техническое обеспечение качества и доступности медицинских услуг» (подпрограмма «Злокачественные опухоли», задание «Разработать и внедрить метод молекулярно-генетической диагностики BCR-ABL1-like острого лимфобластного лейкоза и оценить показатели прогноза при данном типе лейкоза у пациентов детского возраста, подростков и “молодых” взрослых», договор № 02.14/2020).
Как цитировать
Керезь, М. А., Богатенкова, Д. А., Вшивкова, О. С., & Мелешко, А. Н. (2024). Анализ точек разрыва при делециях гена IKZF1 у пациентов с острым лимфобластным лейкозом из В-клеток-предшественников. Экспериментальная биология и биотехнология, 3, 50-58. Доступно по https://journals.bsu.by/index.php/biology/article/view/6259
Раздел
Генетика и молекулярная биология