Молекулярно-генетический анализ acdS-гена бактерий Pseudomonas putida B-37

  • Алеся Андреевна Мельникова Белорусский государственный университет, пр. Независимости, 4, 220030, г. Минск, Беларусь
  • Светлана Игоревна Леонович Белорусский государственный университет, пр. Независимости, 4, 220030, г. Минск, Беларусь
  • Елена Аркадьевна Храмцова Белорусский государственный университет, пр. Независимости, 4, 220030, г. Минск, Беларусь

Аннотация

C помощью полимеразной цепной реакции осуществлен скрининг коллекции бактерий рода Pseudomonas на наличие гена acdS, кодирующего фермент АЦК-дезаминазу. Отмечается, что данный фермент является ингибитором синтеза стрессового этилена, пагубно влияющего на рост и развитие растений. У трех (P. putida B-37, P. putida B-28 и P. putida KT 2442) из пяти исследованных штаммов ризосферных бактерий обнаружен ПЦР-продукт необходимого размера (около 1000 пар нуклеотидов). Определена первичная нуклеотидная последовательность изучаемого фрагмента бактерий P. putida B-37, проведен ее анализ in silico. Сделан вывод о том, что данная последовательность соответствует acdS-гену, который кодирует полноценный функциональный белок, являющийся АЦК-дезаминазой. Использование АЦК-дезаминазы позволит снизить уровень стрессового этилена и уменьшить негативное влияние, оказываемое на растения различными факторами окружающей среды.

Биографии авторов

Алеся Андреевна Мельникова, Белорусский государственный университет, пр. Независимости, 4, 220030, г. Минск, Беларусь

аспирантка кафедры генетики биологического факультета. Научный руководитель – Е. А. Храмцова

Светлана Игоревна Леонович, Белорусский государственный университет, пр. Независимости, 4, 220030, г. Минск, Беларусь

студентка биологического факультета. Научный руководитель – Е. А. Храмцова

Елена Аркадьевна Храмцова, Белорусский государственный университет, пр. Независимости, 4, 220030, г. Минск, Беларусь

кандидат биологических наук; доцент кафедры генетики биологического факультета

Литература

  1. Glick B. R., Todorovic B., Czarny J., et al. Promotion of plant growth by bacterial ACC deaminase. Critical Rev. Plant Sci. 2007. Vol. 26, issue 5 – 6. P. 227–242. DOI: 10.1080/07352680701572966.
  2. Gontia-Mishra I., Sasidharan S., Tiwari S. Recent developments in use of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) deaminase for conferring tolerance to biotic and abiotic stress. Biotechnol. Lett. 2014. Vol. 36, issue 5. P. 889 –898. DOI: 10.1007/s10529014 -1458-9.
  3. Glick B., Pasternak J. Molecular biotechnology: principles and applications of recombinant DNA. Moscow, 2002 (in Russ.).
  4. Glick B. R. Modulation of plant ethylene levels by the bacterial enzyme ACC deaminase. FEMS Microbiol. Lett. 2005. Vol. 251, issue 1. P. 1–7. DOI: 10.1016/j.femsle.2005.07.030.
  5. Marmur J. A procedure for the isolation of deoxyribonucleic acid from micro-organisms. J. Mol. Biol. 1961. Vol. 3. P. 208 –218.
  6. Saravanakumar D. Rhizobacterial ACC deaminase in plant growth and stress amelioration. Bacteria in Agrobiology : stress mana gement. Heidelberg, 2012. P. 187–204. DOI: 10.1007/978-3-642-23465-1_9.
  7. Kamala-Kannan S., Lee K. J., Park S. M., et al. Characterization of ACC deaminase gene in Pseudomonas entomophila strain PS-PJH isolated from the rhizosphere soil. J. Basic Microbiol. 2010. Vol. 50. P. 200 –205.
  8. Kyte I., Doolittle R. F. A simple method for displaying the hydropathic character of a protein. J. Mol. Biol. 1982. Vol. 157. P. 105–132.
  9. Guruprasad K., Bhasker Reddy B. V., Pandit M. Correlation between stability of a protein and its dipeptide composition: a novel approach for predicting in vivo stability of a protein from its primary sequence. Protein Eng., Design Selection. 1990. Vol. 4, No. 2. P. 155–161.
Опубликован
2017-12-16
Ключевые слова: АЦК-дезаминаза, этилен, acdS-ген, Pseudomonas
Как цитировать
Мельникова, А. А., Леонович, С. И., & Храмцова, Е. А. (2017). Молекулярно-генетический анализ acdS-гена бактерий Pseudomonas putida B-37. Экспериментальная биология и биотехнология, 2, 51-57. Доступно по https://journals.bsu.by/index.php/biology/article/view/2445
Выпуск
№ 2 (2017): Журнал Белорусского государственного университета. Биология
Раздел
Генетика, микробиология и молекулярная биология

Авторы, публикующиеся в данном журнале, соглашаются со следующим:

  1. Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial. 4.0 International (CC BY-NC 4.0).
  2. Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договоренности, касающиеся неэксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге) со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.
  3. Авторы имеют право размещать их работу в интернете (например, в институтском хранилище или на персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу. (См. The Effect of Open Access).